STMIK Muhammadiyah Jakarta memiliki lambang yang tergambar sebagai berikut :

• Gambar Matahari.
• Perkataan "Muhammadiyah" dalam tulisan Arab.
• Dua Kalimat Syahadat dalam tulisan Arab.
• Lukisan Padi dan Kapas.
• Kalimat Sekolah Tinggi Manajemen Informatika dan Komputer  Muhammadiyah Jakarta yang membentuk lingkaran.
• Lingkaran segi lima.

Arti dan lambang sebagaimana tersebut diatas adalah :

• Matahari: Benda angkasa luar ciptaan Allah SWT, sinarnya sangat berguna bagi kehidupan semua makhlukNya. Persyarikatan Muhammadiyah menggambarkan gerak dan manfaatnya bagaikan matahari dengan sinarnya yang selalu memberikan manfaat bagi hidup dan kehidupan manusia.
• Perkataan "Muhammadiyah" dalam tulisan Arab adalah nama Persyarikatan Muhammadiyah.
• Dua Kalimat Syahadat dalam tulisan Arab: bermakna penyaksian bahwa sesungguhnya tidak ada Tuhan kecuali Allah SWT dan bahwa sesungguhnya Nabi Muhammad SAW adalah utusan Allah. Keyakinan ini merupakan aqidah yang paling hakiki bagi setiap muslim. Dengan demikian Persyarikatan Muhammadiyah menyeru kepada ummat manusia agar dengan sadar memeluk agama Islam dan menjadi penolong serta penegak Islam
• Lukisan Padi dan Kapas: terdiri dari 19 dan 12 tangkai, gabungan keduanya menunjukkan tahun berdirinya Persyarikatan Muhammadiyah di Indonesia yang juga berarti lambang kemakmuran dan kesejahteraan yang menjadi cita-cita bangsa Indonesia.
• Kalimat Sekolah Tinggi Manajemen Informatika dan Komputer Muhammadiyah Jakarta: lembaga pendidikan tinggi dalam Persyarikatan Muhammadiyah yang berkedudukan di Jakarta.
• Lingkaran segi lima: simbol dalam Falsafah Pancasila.